ตำบลเกาะเต่าเป็นชุมชนที่ก่อตั้งขึ้นมาก่อนปี พ.ศ. 2457 หรือประมาณ 94 ปี โดยมี นายหยู ด้วงรอง เป็นกำนันประจำตำบลเกาะเต่าคนแรก จากข้อมูลบางส่วนที่ได้มาจากผู้สูงอายุภายในตำบลระบุว่าเกาะเต่าขึ้นกับตำบลในเตา อำเภอห้วยยอด จังหวัดตรัง แต่การคมนาคมนั้นมีความลำบาก จึงแบ่งพื้นที่ให้กับอำเภอควนขนุน จังหวัดพัทลุง ดังนั้นตำบลเกาะเต่าจึงเคยเป็นส่วนหนึ่งของตำบลในเตา อำเภอห้วยยอด จังหวัดตรัง

ส่วนที่กล่าวถึงนี้เป็นที่มาของการตั้งชื่อตำบลเพราะว่าในสภาพพื้นที่จริง ๆ ของตำบล เกาะเต่าไม่มีเกาะ แต่ที่มีชื่ออย่างนี้จากข้อมูลสามารถวิเคราะห์ได้ว่า ตั้งชื่ออย่างนี้ เพื่อที่จะสื่อให้รู้ว่า ตำบลเกาะเต่าเคยขึ้นกับตำบลในเตา อำเภอห้วยยอด มาตั้งแต่อดีต